计算和实验研究biliverdin-IXbeta还原酶的催化机理。
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史密斯LJ,布朗年代,穆赫兰AJ,地幔TJ
计算和实验研究biliverdin-IXbeta还原酶的催化机理。
411年5月1;j . 2008 (3): 475 - 84。doi: 10.1042 / BJ20071495。
- PubMed ID
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18241201 (在PubMed]
- 文摘
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BVR-B (biliverdin-IXbeta还原酶)也称为FR(黄素还原酶)是一个滥交的酶催化pyridine-nucleotide-dependent减少各种黄素,胆绿素,PQQ(叫醌)和铁离子。从力学上看这是一个很好的模型BVR-A (biliverdin-IXalpha还原酶),一个潜在的药物目标辅助治疗新生儿黄疸也是一个潜在的目标保持biliverdin-IXalpha在器官移植的防护水平。在评论的结构BVR-B指出这是一个悬而未决的问题仍然是:机制是否共同氢化物转移之后,质子化作用pyrrolic阴离子或质子化作用的吡咯氢化物转移紧随其后。在目前的研究中我们试图解决这个问题使用QM / MM(量子力学、分子力学)计算。QM / MM势能表面显示的最低能量路径收益通过两个带正电的吡咯中间过渡状态。这些最初的计算进行了与他(153)作为源的质子。然而定点诱变研究H153A和H153N变异表明,他不需要(153)催化活性。我们有重复计算溶剂水合氢供体和获得一个类似的能源格局表明吡咯的质子化作用是最可能的第一步之后,氢化物转移所需的质子可能来自大部分溶剂。的影响目前研究BVR-A抑制剂的设计进行了讨论。