Thermoadaptation特征揭示基因组序列的高温Geobacillus kaustophilus。
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高木Takami H, Y, Chee GJ, Nishi年代,Shimamura年代,铃木H,松井,中山教授
Thermoadaptation特征揭示基因组序列的高温Geobacillus kaustophilus。
核酸研究》2004年12月1;32 (21):6292 - 303。打印2004。
- PubMed ID
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15576355 (在PubMed]
- 文摘
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这里我们提出的第一个完整的基因组序列高温Bacillus-related物种,Geobacillus kaustophilus HTA426,由3.54 Mb染色体和一个47.9 kb质粒,以及与其他五个嗜中温杆菌性的基因组比较分析。在同源分组6杆菌性的基因组测序,发现1257个常见的同源组织组成的1308个基因(37%)被所有的共享杆菌,而G的839个基因(24%)。kaustophilus基因组物种被发现是独一无二的。我们能够找到第一个原核的精子鱼精蛋白P1同族体,聚胺合成酶,ABC转运蛋白和RNA聚胺甲基化酶在839独特的基因;这些可能导致thermophily稳定核酸。对比结果与主成分分析(PCA)的氨基酸组成和同义密码子使用高亮显示高温签名的G。kaustophilus基因组。只有在氨基酸组成的PCA Bacillus-related物种附近,但不能区分,边缘型区分嗜热菌和嗜温菌第二主轴。进一步分析发现一些不对称嗜热菌、嗜温菌之间的氨基酸替换,这可能是与有机体的thermoadaptation有关。