第二个II型模块从人类基质金属蛋白酶2:结构、功能和动态。
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Briknarova K, Grishaev Banyai L, Tordai H, Patthy L, Llinas M
第二个II型模块从人类基质金属蛋白酶2:结构、功能和动态。
结构。1999年10月15日,7 (10):1235 - 45。
- PubMed ID
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10545322 (在PubMed]
- 文摘
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背景:基质金属蛋白酶2 (MMP-2,白明胶酶,72 kDa IV型胶原酶)有一个重要的角色在细胞外基质降解细胞迁移和组织重构。参与开发、炎症、伤口愈合、肿瘤侵袭、转移等生理和病理过程。这种酶裂解几种类型的胶原蛋白、弹性蛋白、纤连蛋白、层粘连蛋白等。绑定到胶原蛋白是由三个重复同源纤连蛋白II型模块,插在催化领域接近活性部位。结果:我们已经决定了NMR第二II型模块的解决方案结构从人类MMP-2(第二列)。模块展品典型II型褶皱和两个短的双链反平行的β折叠和三大循环大约一个集群的守恒的芳香残留。骨干酰胺动力学,来自(15)N松弛实验,相关溶剂的可访问性和分子内氢键。胶原蛋白的合成肽共识序列,(Pro-Pro-Gly)(6),与显示模块。结论:谱扰动引起的(Pro-Pro-Gly)(6)绑定揭示该地区参与第二列与胶原蛋白之间的相互作用。绑定表面由暴露芳香残留Phe21, Tyr38, Trp40, Tyr47, Tyr53 Phe55,邻近Gly33-Gly37段。