催化领域的解决方案结构和骨架动态矩阵metalloproteinase-2与异羟肟酸混合抑制剂。
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冯Y, Likos JJ,朱镕基L,伍德沃德H, Munie G,麦当劳JJ,史蒂文斯,霍华德·CP De Crescenzo GA Welsch D, Shieh HS,切除WC
催化领域的解决方案结构和骨架动态矩阵metalloproteinase-2与异羟肟酸混合抑制剂。
Biochim Biophys学报。2002年7月29日,1598 (2):10-23。
- PubMed ID
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12147339 (在PubMed]
- 文摘
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MMP-2是基质金属蛋白酶家族的一员,已经涉及到肿瘤细胞转移和血管生成。在这里,我们描述的解决方案结构催化领域MMP-2与异羟肟酸混合抑制剂(sc - 74020),由三维异核核磁共振光谱学。指定MMP-2C催化域,短肽连接器替代内部fibronectin-domain插入和保持酶的活性。距离geometry-simulated退火计算取得了14聚合结构,原子均方根偏差(r.m.s.d)的1.02和1.62意味着协调立场的骨干和重原子,分别在11残留的n端被排除在外。结构有相同的全球褶皱作为观察其他MMP的催化域和类似于之前解决MMP-2的晶体结构。解决方案之间的差异观察晶体结构,底部附近的S1 '特异性循环,似乎大抑制剂引起的结构出现在解决方案。MMP-2C解决方案结构与MMP-8晶体结构绑定到相同的不同抑制剂特别是在S1 '特异性循环。这一发现提供了一种结构性的解释MMP-2和MMP-8之间是通过选择性抑制剂。