基质金属蛋白酶目标家庭景观:chemometrical方法基于蛋白质配体选择性结合位点的分析。
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Pirard B、H
基质金属蛋白酶目标家庭景观:chemometrical方法基于蛋白质配体选择性结合位点的分析。
J地中海化学。2006年1月12日,49 (1):51 - 69。
- PubMed ID
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16392792 (在PubMed]
- 文摘
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来洞察基质金属蛋白酶(MMP)的结构性因素的家庭,我们56 MMP的结合位点的结构特征和一个别说话(肿瘤坏死因子α转换酶)结构使用分子间相互作用领域(mif)。这些mif所产生的两种方法:网格DrugScore力场和以知识为基础的潜力。后续统计分析使用一致的主成分分析(CPCA)整个结合位点和每个subpockets显示两种方法编码类似信息识别区域。然而,这两种方法之间的探测器的相对重要性不同。CPCA模型提供的以下排名六subpockets基于选择性相互作用的机会,不同的基质金属蛋白酶:S1 ' > S2、S3 S3 ' > S1, S2 '。这些模型的解释同意实验推断从晶体结构或绑定模式对接。