动能的证据表明,肝素抗凝血酶的变构激活是由两个连续的构象变化。
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Schedin-Weiss年代,理查德·B,奥尔森圣
动能的证据表明,肝素抗凝血酶的变构激活是由两个连续的构象变化。
拱生物化学Biophys。2010年12月15日,504 (2):169 - 76。doi: 10.1016 / j.abb.2010.08.021。Epub 2010年9月15日。
- PubMed ID
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20816747 (在PubMed]
- 文摘
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serpin,抗凝血酶,需要变构激活sequence-specific pentasaccharide单位肝素或硫酸乙酰肝素葡糖氨基葡聚糖函数作为凝血抗凝调节器的蛋白酶。令人惊讶的是,x射线结构表明,pentasaccharide产生类似的诱导契合本地肝素结合位点的变化和潜在的肝素抗凝血酶尽管大差异亲和力和全球构造的两种形式。这里我们提供动能的证据为类似pentasaccharide绑定到本地和潜在的抗凝血酶的诱导契合机制和动力学模拟支持三步本机抗凝血酶的变构激活机制涉及连续两个构象的变化。平衡绑定pentasaccharide与本地交互的研究和潜在的抗凝血酶的盐依赖这些交互显示每个构象变化与不同的光谱变化,逐步推动更好地适应pentasaccharide的结合位点。变体,抗凝血酶不能接受第二个构象变化绑定pentasaccharide潜伏抗凝血酶和部分激活表明两种构象变化导致变构激活,在协议最近提议的变构激活模式。