福氏志贺氏菌2a的基因组序列:通过与大肠埃希菌K12和O157的基因组比较了解致病性
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金强,袁志,徐娟,王勇,沈勇,陆伟,王洁,刘浩,杨娟,杨峰,张鑫,张娟,杨刚,吴辉,曲东,董健,孙玲,薛艳,赵安,高勇,朱娟,阚波,丁凯,陈松,程红,姚震,何波,陈睿,马东,强波,文勇,侯勇,于俊
福氏志贺氏菌2a的基因组序列:通过与大肠埃希菌K12和O157的基因组比较了解致病性
核酸研究,2002 10月15日;30(20):4432-41。
- PubMed ID
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12384590 (PubMed视图]
- 摘要
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我们已经对福氏志贺氏菌血清型2a的基因组进行了测序,这是导致人类细菌性痢疾或志贺氏菌病的最常见的种类和血清型。全基因组由一条4 607 203 bp染色体和一条221 618 bp毒力质粒组成,命名为pCP301。虽然质粒显示出与血清型5a测序的轻微差异,但染色体的显著特征已被揭示。令人惊讶的是,弗氏链球菌染色体上有314个IS元素,比它的近亲,非致病性K12菌株和肠出血性O157:H7菌株所拥有的多7倍多。与大肠杆菌序列相比,有13个易位和倒置,均涉及大于5 kb的片段,大多数与缺失或获得性DNA序列相关,其中有几个可能是噬菌体传播的致病性岛。此外,与大肠杆菌菌株相比,弗氏沙门氏菌与另一种人类限制性肠道病原体伤寒沙门氏菌相似,也有数百个假基因。所有这些都可以作为针对志贺氏菌病的新型预防和治疗策略的研究对象。
引用本文的药物库数据
- 多肽
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的名字 UniProt ID 50S核糖体蛋白L10 P0A7J6 细节 UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase P0A751 细节 2- c -甲基- d -赤藓糖醇2,4-环二磷酸合酶 P62619 细节 ADP-ribose焦磷酸酶 P83844 细节 Transaldolase B P0A872 细节 脂肪酸代谢调节蛋白 P0A8V9 细节 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate醛缩酶 P0A716 细节 细胞分裂蛋白ZipA Q83QN9 细节 外膜脂蛋白LolB P61322 细节 S-adenosylmethionine合酶 P0A820 细节 天冬氨酸1-decarboxylase P0A793 细节 4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol激酶 Q83LD8 细节 苏氨酸——tRNA连接酶 P0A8M5 细节 肽蛋氨酸亚砜还原酶MsrA P0A745 细节 5-磷酸核糖异构酶A P0A7Z3 细节 N-acetylneuraminate裂合酶 P0A6L6 细节 水通道蛋白Z O68874 细节 Ribosome-recycling因素 P0A808 细节 Phosphopantetheine adenylyltransferase P0A6I8 细节 硫代硫酸盐硫转移酶GlpE P0A6V7 细节 L-焦点异构酶 P69923 细节 GTP环水解酶 P0A6T8 细节 Adenylosuccinate合成酶 Q83P33 细节 3-hydroxydecanoyl -酰基载体蛋白质脱水酶 P0A6Q5 细节 丝氨酸hydroxymethyltransferase P0A827 细节 延伸系数Tu Q83JC4 细节 Formyl-CoA:草酸CoA-transferase P69903 细节 甲基乙二醛合酶 P0A733 细节 葡萄糖-1-磷酸胸腺苷转移酶2 P61888 细节 天冬氨酸氨甲酰转移酶催化链 P0A789 细节 Thymidylate激酶 P0A721 细节 tRNA (guanine-N(1) -甲基转移酶 P0A876 细节 Nicotinate-nucleotide adenylyltransferase P0A753 细节 触发因素 P0A852 细节 蛋白质RecA P0A7G9 细节 atp依赖的蛋白酶atp酶亚基HslU P0A6H7 细节 脂蛋白MxiM P0A1X2 细节 香叶酰转移酶(法尼基二磷酸合成酶) A0A0H2UXE9 细节