福氏志贺氏菌2a血清型2457T株全基因组序列及比较基因组学。

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Wei J, Goldberg MB, Burland V, Venkatesan MM, Deng W, Fournier G, Mayhew GF, Plunkett G 3rd, Rose DJ, Darling A, Mau B, Perna NT, Payne SM, Runyen-Janecky LJ, Zhou S, Schwartz DC, Blattner FR

福氏志贺氏菌2a血清型2457T株全基因组序列及比较基因组学。

《感染Immun》2003年5月;71(5):2775-86。

PubMed ID

12704152 (PubMed视图

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摘要

我们测定了福氏志贺氏菌血清型2a株2457T (4599354 bp)的全基因组序列。志贺氏菌每年导致100万人死于痢疾和腹泻，其生活方式明显不同于密切相关的细菌，包括大肠杆菌。该基因组显示了大肠杆菌病原体的主干和岛状镶嵌结构，尽管水平转移的DNA要少得多，并且缺乏大肠杆菌中存在的357个基因。该菌株的独特之处在于其大量的插入序列，有几个由插入序列介导的基因组重排，12个隐前噬菌体，372个假基因和195个flexneri特异性基因。2457T基因组也与最近测序的S. flexneri 2a菌株301进行了比较。我们的数据与志贺氏菌与大肠杆菌在系统遗传学上难以区分一致。弗氏链球菌特异性区域包含许多基因，这些基因可以编码在毒性中起作用的蛋白质。这些分析将揭示这种致病生物独特生活方式方面的遗传基础，这些方面尚未得到解释。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
50S核糖体蛋白L10	P0A7J6	细节
UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	P0A751	细节
2- c -甲基- d -赤藓糖醇2,4-环二磷酸合酶	P62619	细节
ADP-ribose焦磷酸酶	P83844	细节
Transaldolase B	P0A872	细节
脂肪酸代谢调节蛋白	P0A8V9	细节
2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate醛缩酶	P0A716	细节
细胞分裂蛋白ZipA	Q83QN9	细节
外膜脂蛋白LolB	P61322	细节
S-adenosylmethionine合酶	P0A820	细节
天冬氨酸1-decarboxylase	P0A793	细节
4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol激酶	Q83LD8	细节
苏氨酸——tRNA连接酶	P0A8M5	细节
肽蛋氨酸亚砜还原酶MsrA	P0A745	细节
5-磷酸核糖异构酶A	P0A7Z3	细节
N-acetylneuraminate裂合酶	P0A6L6	细节
水通道蛋白Z	O68874	细节
Ribosome-recycling因素	P0A808	细节
Phosphopantetheine adenylyltransferase	P0A6I8	细节
硫代硫酸盐硫转移酶GlpE	P0A6V7	细节
L-焦点异构酶	P69923	细节
GTP环水解酶	P0A6T8	细节
Adenylosuccinate合成酶	Q83P33	细节
3-hydroxydecanoyl -酰基载体蛋白质脱水酶	P0A6Q5	细节
丝氨酸hydroxymethyltransferase	P0A827	细节
延伸系数Tu	Q83JC4	细节
Formyl-CoA:草酸CoA-transferase	P69903	细节
甲基乙二醛合酶	P0A733	细节
葡萄糖-1-磷酸胸腺苷转移酶2	P61888	细节
天冬氨酸氨甲酰转移酶催化链	P0A789	细节
Thymidylate激酶	P0A721	细节
tRNA (guanine-N(1) -甲基转移酶	P0A876	细节
Nicotinate-nucleotide adenylyltransferase	P0A753	细节
触发因素	P0A852	细节
蛋白质RecA	P0A7G9	细节
atp依赖的蛋白酶atp酶亚基HslU	P0A6H7	细节
香叶酰转移酶(法尼基二磷酸合成酶)	A0A0H2UXE9	细节