干酪乳杆菌二氢叶酸还原酶与新型亲脂性抗叶酸药物三甲喋呤配合物的结构与动力学。

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波尔沙科夫六世，伯德索尔B，弗兰基尔TA，加尔加罗AR，菲尼J

干酪乳杆菌二氢叶酸还原酶与新型亲脂性抗叶酸药物三甲喋呤配合物的结构与动力学。

蛋白质科学，1999 3月8(3):467-81。

PubMed ID

10091649 (PubMed视图

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摘要

我们确定了干酪乳杆菌二氢叶酸还原酶与抗癌药物三甲喋呤配合物的三维溶液结构。2770距离，345二面角，和144氢键约束从分析多维核磁共振谱记录含有15n标记蛋白的复合物。模拟退火计算得到了22个完全符合约束的结构族。利用一种监测结合配体中动态过程引起的NOE信号的温度效应的新方法，获得了几种分子间蛋白配体NOEs。在低温(5℃)下，结合的三甲氧基环翻转足够慢，在缓慢交换中给出狭窄的信号，从而给出良好的NOE交叉峰。在较高的温度下，它们变宽，它们的NOE交叉峰消失，从而允许低温光谱中的信号被识别为涉及配体质子的NOE。与甲氨蝶呤和甲氧苄氨嘧啶形成的相关配合物的结合位点进行了比较，确定了甲氨蝶呤的结合位点。在不同的配合物之间没有发现主要的构象差异。这三种药物中含有2,4-二氨基嘧啶的部分基本上在相同的结合囊中结合，其分子的其余部分调整了它们的构象，使它们可以与本质上相同的疏水氨基酸组进行有效的范德华斯相互作用，其侧链取向和局部构象在不同的配合物中没有太大的变化(chi1和chi2值相似)。

引用本文的药物库数据

药物靶点

药物	目标	种类	生物	药理作用	行动
Trimetrexate	二氢叶酸还原酶	蛋白质	人类	是的	抑制剂	细节

多肽

的名字	UniProt ID
二氢叶酸还原酶	P00381	细节