域插入大肠杆菌GyrB采用一种新颖的褶皱,在促旋酶中起着关键作用的功能。
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Schoeffler AJ,美联社,伯杰JM
域插入大肠杆菌GyrB采用一种新颖的褶皱,在促旋酶中起着关键作用的功能。
核酸研究》2010年11月,38 (21):7830 - 44。doi: 10.1093 / nar / gkq665。Epub 2010年7月31日。
- PubMed ID
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20675723 (在PubMed]
- 文摘
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染色体成为超螺旋DNA拓扑异构酶管理和组织在所有形式的生命。促旋酶的原核heterotetrameric IIA威尼斯平底渔船,介绍了负超螺旋DNA ATP-dependent链段的机制。所有旋转酶直接同源依赖一组同源的催化域功能;然而,这些酶也能拥有特有的辅助区域。许多革兰氏阴性菌的促旋酶港170 -氨基酸插入金属和未知的体系结构和功能的dna结合蛋白TOPRIM GyrB亚基的域。我们已经确定的结构212 kDa大肠杆菌促旋酶DNA结合和乳沟核心包含这个插入到3.1一项决议。我们发现插入采用一种新颖的、扩展的褶皱,括号GyrB TOPRIM域对其合作伙伴的卷曲螺旋臂GyrA亚基。Structure-guided删除插入大大降低了DNA结合,成为超螺旋和DNA-stimulated atp酶促旋酶的活动。单一氨基酸的突变接触点之间插入和GyrA损害更适中的成为超螺旋和ATP营业额,并且不影响DNA结合。我们的数据表明,插入两个函数,作为立体支撑预配置主dna结合蛋白,和作为一个继电器,可以帮助协调不同职能领域之间的交流。