共价附加喹诺酮类药物对DNA双链末端的影响。
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杜玛，康诺斯，史提尔曼，李华
共价附加喹诺酮类药物对DNA双链末端的影响。
化学学报，2002年4月24日;24(16):4236-46。
- PubMed ID
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11960452 (PubMed视图］
- 摘要
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喹诺酮类是回转酶抑制剂，在临床上被广泛用作抗生素。当以5'-酰基胺取代基共价附着在寡核苷酸上时，喹诺酮类化合物被发现可以稳定寡核苷酸的双链，防止热变性。对于短双元，如qu-T*GCGCA，其中qu是喹诺酮残基，T是5'-氨基-5'-脱氧胸腺嘧啶残基，测量到UV熔点增加高达27.8℃。所有喹诺酮类药物均有稳定作用，即纳利地酸、唑啉酸、哌啶酸、辛沙星、诺氟沙星和氧氟沙星。(oa- t *GCGCA)2的三维结构通过二维核磁共振波谱和约束分子动力学得到，其中oa是一个恶唑酸残基。在该配合物中，杂唑酸残基破坏末端T1:A6碱基对，并堆叠在G2:C5碱基对上。移位的腺苷残基结合在核心双工结构的小槽中，而胸苷残基则与恶唑酸残基结合。由此形成的“分子帽”紧密地贴合在G:C碱基对上，从而提高了碱基对的保真度，这在紫外熔化实验中证明了序列oa-T*GGTTGAC和含有不匹配碱基的目标链。“分子帽”的结构及其被破坏的末端碱基对也可能有助于模拟喹诺酮类药物如何阻止回酶活性位点的DNA链重新连接。