人GAR Tfase在低、高pH和底物-GAR下的晶体结构。
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引用
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张勇,Desharnais J, Greasley SE, Beardsley GP, Boger DL, Wilson IA
人GAR Tfase在低、高pH和底物-GAR下的晶体结构。
生物化学,2002 12月3日;41(48):14206-15。
- PubMed ID
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12450384 (PubMed视图]
- 摘要
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甘氨酸酰胺核糖核苷酸转化酶(GAR Tfase)是一种在从头嘌呤生物合成途径中关键的叶酸依赖酶,因此一直是抗肿瘤药物设计的靶点。在这里,我们描述了人三功能蛋白(purD-purM-purN)的人GAR Tfase (purN)组分在不同pH值下及其底物复合物的晶体结构。人GAR Tfase具有pH依赖性酶活性,其最大活性在pH值7.5-8左右。比较pH 4.2和pH 8.5下未配位的人GAR Tfase结构,可以发现底物结合环构象的差异,pH 4.2占据结合裂口,禁止底物结合,而pH 8.5允许底物结合。在pH值8.5时,GAR Tfase与其天然底物-甘酰胺核糖核苷酸(beta-GAR)的晶体结构证实了这种构象异构。令人惊讶的是,在人类GAR Tfase和之前报道的大肠杆菌GAR Tfase结构之间发现了几个重要的结构差异,后者已被用作药物设计研究的主要模板。虽然大肠杆菌的结构为活性位点和甲酰转移机制提供了有价值的见解,但细菌和哺乳动物酶在结构和抑制方面的差异表明,人类GAR Tfase结构现在是设计抗癌药物的合适模板。