解决方案结构urokinase-type kringle域的纤溶酶原激活物。
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李X, Bokman, Llinas M,史密斯RA,多布森厘米
解决方案结构urokinase-type kringle域的纤溶酶原激活物。
J杂志。1994年2月4日,235 (5):1548 - 59。
- PubMed ID
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8107091 (在PubMed]
- 文摘
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kringle域的解决方案结构urokinase-type纤溶酶原激活物(u-PA)已经决定使用1 h核磁共振光谱和动力学模拟退火的计算。总共35结构,生成20之前使用距离几何方法模拟退火和15使用初始随机生成φ,ψ值,计算了基于946实验核奥佛好塞效应距离约束和48个二面角约束。不含N - c端残留(1到12,77年至82年)和一些表面残留物(M18,按照、S42、D55 R60, G67)无序或灵活、均方根偏差值意味着结构0.49(+ / - 0.14)和0.65(+ / - 0.16)为骨干的一个原子,和1.03(+ / - 0.21)和1.39(+ / - 0.24)一个重原子,分别的两套结构。延长对阴离子多糖如肝素结合位点位于一个相对平坦的分子,包括三个连续的精氨酸,R57, R58和R60(有一个删除在网站59的共识序列),形成一个阳离子三合会面临的溶剂,和两个组氨酸,H37 H40,分子的另一端。比较u-PA kringle结构和组织类型的晶体和核磁共振的解决方案结构纤溶酶原激活物kringle 2表明,两种蛋白质有类似的全球折叠但演示一些地方差异。