高分辨率inhibitor-free催化的解决方案结构片段的人类成纤维细胞胶原酶由多维核磁共振。
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Moy FJ,钱德PK,宇宙年代,皮萨诺先生,则C,威廉J R
高分辨率inhibitor-free催化的解决方案结构片段的人类成纤维细胞胶原酶由多维核磁共振。
生物化学。1998年2月10日,37 (6):1495 - 504。
- PubMed ID
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9484219 (在PubMed]
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inhibitor-free催化的高分辨率解决方案结构片段的人类成纤维细胞胶原酶(金属蛋白酶- 1),18.7 kDa的蛋白质,这是基质金属蛋白酶家族的一员,已经决定使用三维异核核磁共振光谱学。总共30结构计算的混合距离geometry-simulated退火使用3333核磁共振实验限制,包括2409近似interproton距离限制,84距离限制42骨干氢键,426年扭转角限制,125 3 jnhα限制,153 Cα限制,136 Cβ限制。原子均方根分布对30结构意味着协调立场的残留7 - 137和145 - 163是0.42 + / - 0.04的骨干原子,0.80 + / - 0.04所有原子,原子和0.50 + / - 0.03不含无序侧链。金属蛋白酶- 1的整体结构由一个五beta-strands混合组成的β褶板平行和反平行排列和三个阿尔法螺旋。NMR结构的最佳叠加inhibitor-free金属蛋白酶- 1与分辨率1.56 x射线结构Spurlino et al。(Spurlino, j . C。斯莫尔伍德,a . M。卡尔顿,D D。、银行、t M。Vavra, k . J。约翰逊,j·S。,厨师,e·R。Falvo, J。Wahl, r . C。et al .(1994):蛋白质结构。,功能。麝猫。19日,98 - 109年)与hydroxamate混合抑制剂收益率1.22骨架原子rms的差异。大多数的NMR和x射线结构之间的差异发生在附近的金属蛋白酶- 1的活性部位。 This includes an increase in mobility for residues 138-144 and a displacement for the Ca(2+)-loop (residues 74-80). Distinct differences were observed for side-chain torsion angles, in particular, the chi 1 for N80 is -60 degrees in the NMR structure compared to 180 degrees in the X-ray. This results in the side chain of N80 occupying and partially blocking access to the active site of MMP-1.