分析人类protein-DNA interactome揭示ERK2的转录阻遏干扰素信号。
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分析人类protein-DNA interactome揭示ERK2的转录阻遏干扰素信号。
细胞。2009年10月30日,139(3):610 - 22所示。doi: 10.1016 / j.cell.2009.08.037。
- PubMed ID
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19879846 (在PubMed]
- 文摘
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Protein-DNA交互(pdi)调解范围广泛的功能必不可少的细胞分化、功能和生存。然而,这仍然是一个艰巨的任务,全面识别和剖面sequence-specific pdi在复杂的基因组。在这里,我们使用了一个结合生物信息学和蛋白质芯片战略系统地描述人类protein-DNA interactome。我们确认17718 pdi DNA主题预测调节转录和460 - 4191年间人类蛋白质的各种功能类。其中,我们恢复了许多认识pdi转录因子(TFs)。我们发现大量的意外pdi TFs,以及先前无特征TFs。我们还发现,超过三百的dna结合蛋白(uDBPs)——包括rna结合蛋白、线粒体蛋白和蛋白激酶——显示sequence-specific pdi。这样一个uDBP ERK2,充当一个射线诱发干扰素基因转录抑制因子,提出重要的生物作用等蛋白质。