蛋白质组学鉴定细胞外空间的组件在人类主动脉。
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殷Didangelos A, X, Mandal K, Baumert M, Jahangiri M,娃M
蛋白质组学鉴定细胞外空间的组件在人类主动脉。
摩尔细胞蛋白质组学。2010年9月,9 (9):2048 - 62。doi: 10.1074 / mcp.M110.001693。Epub 2010年6月15日。
- PubMed ID
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20551380 (在PubMed]
- 文摘
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血管细胞外基质(ECM)对血管壁的结构完整性至关重要,也作为衬底的绑定和保留分泌血管细胞以及分子的产品来自循环。之前虽然蛋白质组学应用于血管组织,很少有研究专门针对血管ECM及其相关的蛋白质。因此,它的详细成分还有待特征。在这项研究中,我们描述的方法从人类主动脉细胞外蛋白质的提取及其蛋白质组学鉴定。方法是基于(一)有效的去细胞为稀缺的细胞外蛋白质丰富,(b)成功的增溶和deglycosylation ECM的蛋白质,和(c)相对评估使用光谱计算蛋白质的丰度。我们三步提取方法导致了103年的识别细胞外蛋白质的三分之一从未报道血管组织的蛋白质组学文学。特别是,三个糖蛋白(podocan sclerostin,微笑地)被确定为第一次在人类主动脉在蛋白质水平。我们还发现了细胞外脂肪细胞enhancer-binding蛋白1,软骨糖蛋白asporin,和以前假设的蛋白质,视网膜色素上皮细胞(RPE) spondin。此外,我们的方法允许我们屏幕上基于识别的主动脉样品中蛋白质水解蛋白水解酶及其相应的降解产物。例如,我们能够检测矩阵metalloproteinase-9通过质谱和与它的存在降解纤连蛋白的临床标本。 We expect this proteomics methodology to further our understanding of the composition of the vascular extracellular environment, shed light on ECM remodeling and degradation, and provide insights into important pathological processes, such as plaque rupture, aneurysm formation, and restenosis.