两个晶体结构组织蛋白酶D:溶酶体目标信号和活性部位。
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麦特卡尔夫P, Fusek M
两个晶体结构组织蛋白酶D:溶酶体目标信号和活性部位。
4月EMBO j . 1993; 12 (4): 1293 - 302。
- PubMed ID
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8467789 (在PubMed]
- 文摘
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两个晶体结构描述的溶酶体组织蛋白酶D天冬氨酸的蛋白酶(EC 3.4.23.5)。分子置换法与x射线衍射数据3解决生产结构对人类脾脏组织蛋白酶D和牛肝组织蛋白酶D包裹着6-peptide抑制剂抑肽素A先前定义的溶酶体组织蛋白酶D目标地区的表达研究[Barnaski et al。(1990)细胞,63年,281 - 219年)坐落在定义良好的电子密度表面的分子。这个地区包括的假定的结合位点cis-Golgi磷酸转移酶负责可溶性蛋白溶酶体的初始排序步骤通过磷酸化这些分子的碳水化合物。碳水化合物的密度是可见的在预期位置组织蛋白酶D分子,在最好的位置,定义四个糖残基对溶酶体目标地区扩展。蛋白酶的活性部位和活性部位间隙衬底绑定使用抑肽素抑制结构描述子。模型几何对人类组织蛋白酶D rms偏离理想的债券和角度分别为0.013和3.2度。牛组织蛋白酶D对应的数字是0.014和3.3度。晶体的残差(R因素)分别为16.1%和15.8%的人类和抑制牛分别组织蛋白酶D模型。免费的R因子,计算了10%的数据用于测试模型,而不是用于细化,分别是25.1%和24.1%。