转化生长因子β 1:溶液中的三维结构及与转化生长因子β 2的x射线结构比较。
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Hinck AP, Archer SJ, Qian SW, Roberts AB, Sporn MB, Weatherbee JA, Tsang ML, Lucas R, Zhang BL, Wenker J, Torchia DA
转化生长因子β 1:溶液中的三维结构及与转化生长因子β 2的x射线结构比较。
生物化学。1996 7月2日;35(26):8517-34。
- PubMed ID
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8679613 (查看PubMed］
- 摘要
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利用多核磁共振波谱和混合距离几何/模拟退火算法确定了人体转化生长因子β 1 (tgf - β 1)的三维溶液结构。这是通过真核细胞系中蛋白质的同位素标记和多核核磁共振波谱法解决的哺乳动物蛋白质结构的第一个例子。从3200多距离和二面角约束条件下计算了25 kDa二硫连接tgf - β 1同型二聚体的溶液结构。33个入选结构的最终组合均未出现NOE和二面角违反分别大于0.30 A和5.0°的情况。当所有残基都用于对齐时，33个结构的主链原子相对于其平均结构的RMSD为1.1 A，当省略环区时为0.7 A。tgf - β 1的溶液结构遵循tgf - β 2的两个独立确定的晶体结构(Daopin et al.， 1992,1993;Schlunegger & Grutter, 1992, 1993)，首次提供了在分子水平上检验两种异构体之间结构差异的机会。虽然结构非常相似，当在比对中忽略环区时，主链原子位置的RMSD为1.4 A，当考虑所有残基时，RMSD为1.9 A，但在结构和灵活性方面仍有一些显著的差异，这可能与功能有关。最明显的例子是来自残基69-72的-转弯:在tgf - β 1的溶液结构中发现的转弯类型属于II型，而在tgf - β 2的x射线晶体结构中发现的转弯类型更符合I型的转弯构象。这可能具有功能意义，因为使用tgf - β嵌合体和缺失突变体的研究表明，该分子的这部分可能在受体结合中很重要。