极性相互作用的作用与其受体CD40 CD40L的分子识别。
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辛格J,加伯E, Van Vlijmen H, Karpusas M,许YM,郑Z,奈史密斯JH,托马斯·D
极性相互作用的作用与其受体CD40 CD40L的分子识别。
蛋白质科学。1998年5月,7 (5):1124 - 35。
- PubMed ID
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9605317 (在PubMed]
- 文摘
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CD40配体(CD40L)是暂时性的t细胞表面的表达和CD40结合b细胞表面表达。这个绑定事件导致了分化,增殖,和同形像切换的b细胞。CD40L的生理重要性已经被事实证明有缺陷的CD40L的表达蛋白引起免疫缺陷状态的特点是高IgM和低血清免疫球蛋白水平,表明错误的b细胞活化t细胞依赖。理解CD40 / CD40L的结构性基础协会,我们使用的结合分子建模、诱变和x射线晶体学。CD40L的细胞外区域的结构决定了蛋白质晶体学,而CD40受体建成使用同源建模基于一本小说对齐的肿瘤坏死因子受体超家族,和使用的x射线结构TNF受体作为模板。模型表明,复杂的接口是由带电残基,CD40L呈现基本侧链(K143, R203 R207)和CD40呈现酸性侧链(D84, E114 E117)。通过定点诱变这些残留进行了研究实验,理论上也用静电计算程序Delphi。诱变数据探索带电残基的作用在这两个CD40L和CD40切换到阿拉巴马州(K143A、R203A R207A CD40L、和E74A D84A, E114A, E117A CD40),电荷逆转(K143E、R203E R207E CD40L、和D84R E114R, E117R CD40),变异极地残渣(K143N、R207N R207Q CD40L、和D84N E117N CD40), CD40L的基本侧链,等排的替换一个疏水侧链(R203M R207M)。所有的电荷反转突变体和大多数的满足和阿拉巴马州替换导致失去约束力,建议稳定复杂的交互。这是Delphi支持的计算,证实了CD40 / CD40L残渣对E74-R203, D84-R207, E117-R207净稳定影响复杂。 However, the substitution of hydrophilic side chains at several of the positions was tolerated, which suggests that although charged interactions stabilize the complex, charge per se is not crucial at all positions. Finally, we compared the electrostatic surface of TNF/TNFR with CD40L/CD40 and have identified a set of polar interactions surrounded by a wall of hydrophobic residues that appear to be similar but inverted between the two complexes.