维甲酸诱导的人红白血病细胞mRNA编码一种新的组织转谷氨酰胺酶同源物。
文章的细节
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引用
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Fraij BM, Birckbichler PJ, Patterson MK Jr, Lee KN, Gonzales RA
维甲酸诱导的人红白血病细胞mRNA编码一种新的组织转谷氨酰胺酶同源物。
《生物化学杂志》1992年11月5日;267(31):22616-23。
- PubMed ID
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1358880 (PubMed视图]
- 摘要
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从维甲酸诱导的人红白血病(HEL)细胞中克隆并测序了一种新的转谷氨酰胺酶蛋白的1.9 kb cDNA。全长cDNA分析显示一个开放的阅读框,编码548个氨基酸残基,分子量为61740。推导出的氨基酸序列与人细胞谷氨酰胺转胺酶序列具有98%的同源性。活性位点277位的半胱氨酸和细胞谷氨酰胺转胺酶446-453残基上的Ca(2+)结合口袋是保守的。这些证据预测编码的蛋白质产物可能是谷氨酰胺转胺酶同源物(TGase-H)。对合成的TGase-H mRNA和培养的红白血病HEL细胞总蛋白的体外翻译产物进行免疫沉淀,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳,发现一个分子量为63000的蛋白质。使用细胞TGase探针对HEL细胞和正常人成纤维细胞WI-38进行Northern blot分析,检测到1.9-和4.0-kb RNA物种,相对丰度分别为1:3和1:7。人类细胞谷氨酰胺转胺酶mRNA的3'端也被克隆并测序,以便与本文报道的TGase-H的3'端进行比较。这个新片段为人类细胞谷氨酰胺转胺酶提供了4012个核苷酸(4.0 kb)的全长。比较1.9 kb和4.0 kb cDNA序列的5'端(碱基1-1747)显示了高度的同源性。 Beginning with base 1748, the sequences diverge showing no homology. The divergence point correlates with known intron-exon consensus boundaries indicative of alternative splicing.