2.4-A分辨率下组织纤溶酶原激活物kringle 2结构域的晶体结构。
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德沃斯AM，乌尔奇MH，凯利RF，帕德马纳班K，图林斯基A，威斯布鲁克ML，科西亚科夫AA
2.4-A分辨率下组织纤溶酶原激活物kringle 2结构域的晶体结构。
生物化学。1992 1月14日;31(1):270-9。
- PubMed ID
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1310033 (PubMed视图］
- 摘要
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在2.43 a的分辨率下测定并细化了组织型纤溶酶原激活物kringle 2结构域的晶体结构。分子的整体折叠与凝血酶原kringle 1和纤溶酶原kringle 4相似;然而，在赖氨酸结合口袋中存在差异，两个环区域，包括kringle 2的插入，具有非常不同的构象。在对kringle 2和kringle 4的整体结构同源性进行比较的基础上，提出了一种新的kringle结构域序列比对方法，该方法将kringle结构域划分为两组，与所提出的进化关系一致。晶体结构显示了一个分子的赖氨酸残基与非晶体学相关的相邻的赖氨酸/纤维蛋白结合袋之间的强相互作用。这种相互作用代表了结合蛋白配体的良好模型，并且是在kringle结合口袋中观察到的第一个这样的配体。该结构显示了结合袋残基之间以及结合袋残基与赖氨酸配体之间复杂的相互作用网络。赖氨酸侧链被确定为定位与赖氨酸和赖氨酸类似配体的羧酸相互作用的正电荷基团。此外，一个氯离子位于kringle-kringle界面，并有助于观察到kringle分子之间的相互作用。