绑定的磷酸盐和焦磷酸离子活性部位的x射线晶体学揭示了人类血管生成素。
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列奥尼达DD, Chavali GB,怡和,李年代,夏皮罗R, Acharya KR
绑定的磷酸盐和焦磷酸离子活性部位的x射线晶体学揭示了人类血管生成素。
蛋白质科学。2001年8月,10 (8):1669 - 76。
- PubMed ID
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11468363 (在PubMed]
- 文摘
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人类血管生成素(Ang)是一个不寻常的相同器官的牛胰核糖核酸酶,利用其ribonucleolytic活动诱导新血管的形成。Ang的pyrimidine-binding网站显示之前被谷氨酰胺117,表明Ang必须经历一个绑定的构象变化和裂开的RNA。这种变化的机制和自然是不知道,也没有Ang-inhibitor复合体是迄今为止的结构特征。在这里,我们报告与抑制剂复合物的晶体结构和磷酸盐和焦磷酸,和复杂的结构与磷酸Q117G superactive盎变体,2.0一项决议。磷酸盐结合的催化部位Ang和Q117G本质上相同的方式观察到的核糖核酸酶磷酸盐复杂,形成氢键的侧链13日,114年,和Gln 12日和115年低浓缩铀的主链;它让一个额外的交互与赖氨酸40铵组和复杂。的一个磷酸基焦磷酸占据了一个相似的职位。其他磷酸盐延伸向Gln 117,位于氢键距离的侧链酰胺残留以及他13的咪唑组和低浓缩铀的主链氧气115。嘧啶站点仍然阻塞在所有三个复杂的结构,也就是说,绑定到催化中心不足以引发催化活性所需的构象变化,即使没有Gln 117侧链。Ang-pyrophosphate复杂结构表明焦磷酸核苷抑制剂如何绑定到Ang; this information may be useful for the design of Ang antagonists as potential anti-angiogenic drugs.