肠道沙门菌血清型鼠伤寒LT2全基因组序列。

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McClelland M, Sanderson KE, Spieth J, Clifton SW, Latreille P, Courtney L, Porwollik S, Ali J, Dante M, Du F, Hou S, Layman D, Leonard S, Nguyen C, Scott K, Holmes A, Grewal N, Mulvaney E, Ryan E, Sun H, Florea L, Miller W, Stoneking T, Nhan M, Waterston R, Wilson RK

肠道沙门菌血清型鼠伤寒LT2全基因组序列。

自然科学。2001年10月25日;413(6858):852-6。

PubMed ID

11677609 (PubMed视图

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摘要

沙门氏菌亚种I，血清型鼠伤寒菌(S. Typhimurium)，是人类胃肠炎的主要原因，并被用作人类伤寒的小鼠模型。非伤寒沙门氏菌病的发病率在世界范围内不断增加，每年造成数百万人感染和许多人死亡。我们对鼠伤寒沙门氏菌LT2株的4857 kb染色体和94 kb毒力质粒进行了测序。在8种相关肠杆菌中，鼠伤寒沙门氏菌LT2基因密切同源物的分布是通过之前完成的3种相关细菌的基因组、肠道沙门氏菌血清型副伤寒A (S. Paratyphi A)和肺炎克雷伯菌的样本测序，以及将3个未测序的基因组杂交到鼠伤寒沙门氏菌LT2基因微阵列来确定的。基因的横向转移是经常发生的，伤寒沙门氏菌LT2基因中有11%缺失，大肠埃希菌K12基因中有29%缺失。鼠伤寒沙门氏菌LT2的352个同源基因局限于肠内沙门氏菌的I亚种，含有大多数哺乳动物和鸟类病原体，这对流行病学、宿主特异性和发病机理的研究是有用的。这些同源物中的大多数以前是未知的，其中50个可能被输出到周质或外膜，使它们成为治疗或疫苗靶点。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
Nicotinate-nucleotide——dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase	Q05603	细节
氮调节蛋白NR(I)	P41789	细节
烟酸核苷酸焦磷酸化酶[羧化]	P30012	细节
甲基接受趋化蛋白II	P02941	细节
Hydroxymethylpyrimidine / phosphomethylpyrimidine激酶	P55882	细节
UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose——氧化戊二酸氨基转移酶	Q8ZNF3	细节
Orotate phosphoribosyltransferase	P08870	细节
唾液酸酶	P29768	细节
Threonine-phosphate脱羧酶	P97084	细节
5-epimerase dTDP-4-dehydrorhamnose 3日	P26394	细节
6-dehydratase CDP-glucose 4日	P26397	细节
6-dehydratase dTDP-glucose 4日	P26391	细节
二磷酸核糖核苷还原酶2亚基	Q08698	细节
谷氨酰胺合成酶	P0A1P6	细节
Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase	P26393	细节
乙酰辅酶A合成酶	Q8ZKF6	细节
酰基载体蛋白	P0A6B1	细节
dTDP-4-dehydrorhamnose还原酶	P26392	细节
Siroheme合酶	P25924	细节
趋化性蛋白甲基转移酶	P07801	细节
双功能腺苷钴胺素生物合成蛋白CobU	Q05599	细节
Glucose-1-phosphate cytidylyltransferase	P26396	细节
烷基过氧化氢还原酶亚基F	P19480	细节
尿苷磷酸化酶	P0A1F6	细节
FMN-dependent NADH-azoreductase	P63462	细节
d -半乳糖结合质周蛋白	P23905	细节
Maltoporin	P26466	细节
质周寡肽结合蛋白	P06202	细节
色氨酸合成酶α链	P00929	细节
色氨酸合酶链	P0A2K1	细节
毒力传感器组氨酸激酶PhoQ	P0DM80	细节