探索卤代烷的结构和活动从Sphingomonas dehalogenase paucimobilis UT26:依据产品——water-mediated抑制。
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奥克利AJ, h神Z, Bohac M, Kmunicek J, Jedlicka T, Monincova M, Kuta-Smatanova我经营着Y, Damborsky J, Wilce MC
探索卤代烷的结构和活动从Sphingomonas dehalogenase paucimobilis UT26:依据产品——water-mediated抑制。
生物化学。2002年4月16日,41 (15):4847 - 55。
- PubMed ID
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11939779 (在PubMed]
- 文摘
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卤代烷的水解相应的醇类和无机卤化物是由α/ beta-hydrolases称为催化卤代烷dehalogenases。卤代烷的研究dehalogenases对这些酶的发展至关重要,如果他们要利用organohalide-contaminated工业废弃物的生物修复。我们报告的动力学和结构分析,卤代烷dehalogenase从Sphingomonas paucimobilis UT26 (LinB)在复杂的1,二氯乙烷,2-dichloropropane 1-chlorobutane营业额的反应产物。活动研究显示非常疲弱,但检测活动的LinB 1,二氯乙烷[0.012 nmol年代(1)(毫克的酶)(1)]和1,2-dichloropropane [0.027 nmol年代(1)(毫克的酶)(1)]。这些活动相比弱得多,例如,与1-chlorobutane LinB的活动[68.2 nmol年代(1)(毫克的酶)(1)]。抑制分析表明,这两个1,二氯乙烷,2-dichloropropane充当简单的竞争性抑制剂衬底1-chlorobutane 1,二氯乙烷结合LinB亲和力较低,2-dichloropropane。对接计算在缺乏酶活性部位水分子和卤化物离子证实,这些化合物可以有效结合。然而,这些根被包括在计算时,绑定的方式类似于晶体结构中观察到。这些数据提供了一种解释LinB的低活性小,氯化烷烃和水分子活性位点的重要性和反应产物在分子对接。