合理调制构象波动腺苷酸激酶揭示当地展开变构效应机制和功能适应蛋白质。
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DW,双门衣柜TP,保伦Hilser VJ
合理调制构象波动腺苷酸激酶揭示当地展开变构效应机制和功能适应蛋白质。
《美国国家科学院刊S a . 2009年10月6日,106 (40):16984 - 9。doi: 10.1073 / pnas.0906510106。Epub 2009年9月21日。
- PubMed ID
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19805185 (在PubMed]
- 文摘
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阐明蛋白质结构和动力学之间的复杂的相互作用是一个先决条件的理解都在蛋白质功能和适应。不幸的是,它已经很难通过实验分离这些影响,因为它是具有挑战性的合理设计突变会影响结构而不是动力学,或将影响动力学结构。这里我们采用突变的方法,是根据观察到的热适应策略在自然界中,我们用它来研究绑定交互的大肠杆菌腺苷酸激酶(AK)。我们理性地设计几个单,surface-exposed甘氨酸突变来选择性地扰乱激发态构象,留下极化子x射线晶体结构不受影响。结果不仅证明构象合奏的AK明显密集展开状态数量都在本地绑定,但是也可以通过操纵,激发态构象合奏突变,独立于扰动的基态结构。这些结果的影响是双重的。首先,他们表明,可以合理设计动态变构突变,不传播通过结构扭曲的路径连接变异和功能的网站。其次,同样重要的是,结果显示热适应的一般策略,允许酶调节亲和力通过控制的地方展开自然态。这些发现为理性的蛋白质设计开辟新的途径,从根本上阐明的角色功能和适应当地的展开。