结构的胞质NADP-dependent异柠檬酸脱氢酶活动的揭示小说的自律机制。
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徐X,赵J,徐Z,彭B,黄问,阿诺德E,丁J
结构的胞质NADP-dependent异柠檬酸脱氢酶活动的揭示小说的自律机制。
生物化学杂志。2004年8月6日,279 (32):33946 - 57。Epub 2004 6月1。
- PubMed ID
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15173171 (在PubMed]
- 文摘
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异柠檬酸脱氢酶(IDHs)催化氧化脱羧alpha-ketoglutarate异柠檬酸,和监管IDHs酶活性的生物功能是至关重要的。细菌性IDHs可逆磷酸化调节的严格守恒的丝氨酸残基的活性部位。真核NADP-dependent IDHs (NADP-IDHs)已被证明有不同的重要的生物功能;然而,他们的监管机制尚不清楚。结构研究人类的胞质NADP-IDH (HcIDH)与辅酶ii复杂辅酶ii和复杂,异柠檬酸,Ca2 +揭示三个生物相关酶的构象状态大大不同活性部位的结构和整体结构。结构部分的活性部位形成一个守恒的阿尔法螺旋在所有已知NADP-IDH结构构象的假设一个循环,HcIDH的活动形式;部分瓦解半开的α螺旋,中间形式;和一个α螺旋的关闭,活动形式。Asp279的侧链,这部分占isocitrate-binding站点和形成氢键Ser94(相当于细菌IDHs)的磷酸化网站的活动形式和螯合物中的金属离子活性形式。结构数据让我们提出一个新颖的自律机制HcIDH模仿磷酸化机制使用的细菌同源染色体,与生化和生物数据一致。 This mechanism might be applicable to other eukaryotic NADP-IDHs. The results also provide insights into the recognition and specificity of substrate and cofactor by eukaryotic NADP-IDHs.