大肠杆菌基因组的系统测序:0-2.4 min区域分析。

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Yura T, Mori H, Nagai H, Nagata T, Ishihama A, Fujita N, Isono K, Mizobuchi K, Nakata A

大肠杆菌基因组的系统测序:0-2.4 min区域分析。

核酸研究。1992 july 11;20(13):3305-8。

PubMed ID

1630901 (PubMed视图

］

摘要

作为完成基因组结构分析的第一步，确定了与大肠杆菌染色体0 ~ 2.4 min区域相对应的111402个核苷酸序列。所得到的序列用于预测开放阅读帧，并根据PIR蛋白数据库搜索序列相似性。必威国际app发现了一些新的基因，其预测的蛋白质序列与各种生物的已知蛋白质具有显著的同源性，包括一些类似于细菌脂肪酸代谢(如betT, baiF)和高等生物的基因簇，粘质沙雷菌的铁转运(sfuA, B, C)，以及偶氮hizobium caulinodans的共生固氮或电子转运(fixA, B, C, X)。此外，还鉴定了一些已绘制但未测序的基因和IS元件(如leuA, B, C, D)。我们估计大约有90个基因在染色体的这个区域有很少的间隔。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
UDP-N-acetylmuramoylalanine——D-glutamate连接酶	P14900	细节
udp - n -乙酰氨基葡萄糖转移酶n -乙酰muramyl-(五肽)焦磷酸-十一烯醛n -乙酰氨基葡萄糖转移酶	P17443	细节
8-oxo-dGTP diphosphatase	P08337	细节
UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate——2,6-diaminopimelate连接酶	P22188	细节
4-hydroxythreonine-4-phosphate脱氢酶	P19624	细节
左卡尼汀CoA-transferase	P31572	细节
4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate还原酶	P04036	细节
二氢叶酸还原酶	P0ABQ4	细节
阿拉伯糖操纵子调节蛋白	P0A9E0	细节
肽聚糖合成酶FtsI	P0AD68	细节
4-羟基-3-甲基-2-烯基二磷酸还原酶	P62623	细节