晶体结构的UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyltransferase,抗生素磷霉素的目标。
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美泉宫E,解雇,Eschenburg年代,Perrakis, Krekel F,阿大常务副校长阿姆雷恩N, Mandelkow E
晶体结构的UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyltransferase,抗生素磷霉素的目标。
结构。1996年9月15日,4 (9):1065 - 75。
- PubMed ID
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8805592 (在PubMed]
- 文摘
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背景:抗生素耐药细菌的数量不断增加新的抗生素的发展引发了兴趣和其他抗菌药物。细菌细胞壁的主要结构元素是杂聚合物肽聚糖和肽聚糖酶的生物合成是抗菌药物的潜在目标。就是这样一个酶UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyltransferase (EPT)催化肽聚糖生物合成过程中提交的第一步:转让enolpyruvyl一半的磷酸烯醇丙酮酸(PEP)的3-hydroxyl UDP-N-acetylglucosamine (UDPGlcNAc)。EPT潜在药物的兴趣,因为它是由广谱抗生素磷霉素抑制。结果:晶体结构的substrate-free EPT已经确定在2.0一项决议。揭示了两个域蛋白质结构与一个不寻常的褶皱(内外α/β桶),这是建立一个折叠单元的重复的6倍。唯一的氨基酸序列中的重复元素是一个简短的主题,Leu-X3-Gly (Ala),负责折叠单元之间的相互作用形成氢键的形成。对EPT酶催化类似反应,5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate合成酶(EPSPS),有一个非常相似的结构,尽管只有25%的氨基酸序列的身份。迄今为止,只有这两个酶似乎显示这一特点褶皱。结论:目前的结构反映了开放构型的酶可能是通过两个残留稳定,赖氨酸和精氨酸,位于域之间的间隙。 Binding of the negatively charged UDPGlcNAc to these residues could neutralize the repulsive force between the two domains, thereby allowing the movement of a catalytically active cysteine residue towards the cleft.