大肠杆菌的两种基本机制ADP-L-glycero-D-manno-heptose 6-epimerase。
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莫里森JP,坦纳我
大肠杆菌的两种基本机制ADP-L-glycero-D-manno-heptose 6-epimerase。
生物化学。2007年3月27日,46 (12):3916 - 24。Epub 2007年2月23日。
- PubMed ID
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17316025 (在PubMed]
- 文摘
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ADP-l-glycero-d-manno-heptose 6-epimerase (HldD或AGME,原名RfaD)催化其他配置的反演的“庚糖一半ADP-d-glycero-d-manno-heptose ADP-l-glycero-d-manno-heptose。的差向异构酶HldD运作l-glycero-d-manno-heptose的生物合成途径,这是一种守恒的糖核心地区的脂多糖(LPS)的革兰氏阴性细菌。先前的研究支持的机制HldD利用其紧密地绑定其他辅酶ii +代数余子式氧化直接“,生成酮的中间体。减少酮从相反的脸上然后发生,生成epimeric产品。如何可以访问两面差向异构酶的酮与所需的三个组件的正确对齐,中间NADPH,酮羰基,催化酸/碱残留,在这里解决。提出,差向异构酶活性部位包含两个催化口袋,每个熊催化酸/碱残留,有利于减少其他“酮但导致不同的epimeric产品。酮羰基可以访问口袋里通过旋转的c - 5“-C-6“债券糖核苷酸和这样做的礼物反对面临到绑定代数余子式。证据支持两种基本的机制是在两个单突变体的研究发现大肠杆菌的k - 12差向异构酶,Y140F K178M,这两个严重受损的差向异构酶活动超过3个数量级低于野生型的。这两个突变体的催化能力促进氧化还原化学演示了另一种催化活性,只需要一个催化基础:歧化作用的其他“醛底物类似物(ADP-beta-d-manno-hexodialdose)酸和酒精(ADP-beta-d-mannuronic酸和ADP-beta-d-mannose)。本研究确定了两个催化酪氨酸140和赖氨酸178基地。 A one-step enzymatic conversion of mannose into ADP-beta-mannose is also described and used to make C-6' '-substituted derivatives of this sugar nucleotide.