伯克xenovorans LB400港口multi-replicon, 9.73 mbp基因的多功能性。
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伯克xenovorans LB400港口multi-replicon, 9.73 mbp基因的多功能性。
《美国国家科学院刊S a . 2006年10月17日;103 (42):15280 - 7。Epub 2006 10月9。
- PubMed ID
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17030797 (在PubMed]
- 文摘
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伯克xenovorans LB400 (LB400),深入研究,有效的多氯biphenyl-degrader,最大的两个已知的细菌基因组和是第一个不致病的洋葱隔离测序。从进化的角度来看,我们发现显著差异之间的功能专门化的三个经由LB400,以及一个更宽松的选择性基因位于两个较小的压力与最大的复制子。基因组可塑性高,多样性,这种属内和专业化以保护LB400之间只有44%的基因和洋葱不过复杂应变383。甚至在4 b . xenovorans菌株基因组大小变化从7.4到9.73 Mbp。后者主要是解释我们的发现,> 20%的LB400序列最近收购了通过横向基因转移。尽管一系列的遗传因素与体内生存和细胞间的相互作用,这些遗传因素可能与生态位宽度而非致病性的决定因素。的存在至少十一20“芳香中心”和“外围芳香”LB400通路,在任何细菌基因组测序中最高,支持这一假说。最后,除了实验观察到冗余在苯甲酸降解和甲醛氧化途径,事实上,17.6%的蛋白质有更好LB400假字比直接同源不同基因组强调基因重复和重复获取的重要性,,再加上他们的分歧,提出了问题的角色假字和潜在的功能冗余large-genome微生物。