结构的两种penicillin-binding动能中间体揭示物种特异性的蛋白质。
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麦克多诺马,安德森JW Silvaggi NR,普拉特射频,小诺克斯,凯利农协
结构的两种penicillin-binding动能中间体揭示物种特异性的蛋白质。
J杂志。2002年9月6日,322(1):111 - 22所示。
- PubMed ID
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12215418 (在PubMed]
- 文摘
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Penicillin-binding蛋白(是),目标beta-lactam抗生素如青霉素和头孢菌素酶,催化最后细菌细胞壁的肽聚糖交联一步合成。beta-Lactams抑制这种反应,因为他们模仿D-alanyl-D-alanine细胞壁结构的肽前体。之前晶体研究描述beta-lactam绑定和抑制的网站,但他们未能显示D-Ala-D-Ala基质的绑定。我们这里现在PBP第一个高分辨率的晶体结构,链霉菌属的D-Ala-D-Ala-peptidase sp.应变R61,非共价包裹着一个高度的特定片段(glycyl-L-alpha-amino-epsilon-pimelyl-D-Ala-D-Ala)细胞壁前体es和enzyme-product形式。的分辨率1.9结构es Henri-Michaelis复杂是通过使用灭活酶,由交联形成两个催化地重要残留Tyr159 Lys65。第二个结构在1.25解决uncross-linked, DD-peptidase显示了非共价结合的活性形式的两个产品羧肽酶反应。两个晶体结构的定义良好的substrate-binding网站显示的子站补充一部分自然细胞壁基质不同细菌物种之一。此外,结构的位移11水分子活性位点,残留的位置负责衬底绑定,并清晰地展示Lys65的必要性和或Tyr159与捐赠者肽酰化的步骤。这里描述的复杂结构的比较与其他已知的结构是表明species-targeted的设计对beta-lactamase-elicited细菌抵抗抗生素作为对策。