骨干灵活性、构象变化和催化phosphohexomutase铜绿假单胞菌。
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施拉姆,Mehra-Chaudhary R, Furdui厘米,投影机LJ
骨干灵活性、构象变化和催化phosphohexomutase铜绿假单胞菌。
生物化学。2008年9月2,47 (35):9154 - 62。doi: 10.1021 / bi8005219。Epub 2008年8月9日。
- PubMed ID
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18690721 (在PubMed]
- 文摘
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酶phosphomannomutase / phosphoglucomutase (PMM / PGM)铜绿假单胞菌的细菌参与一些复杂的生物合成碳水化合物,包括海藻酸、脂多糖和鼠李糖脂。之前有这种蛋白质的结构研究表明,结合底物产生一个旋转的c端领域,改变酶蛋白的活性位点从一个开放的裂成一个深,溶剂进口袋,磷酰基转移发生。我们报告此定点诱变、动力学和结构研究检查残留的作用域3和4之间的铰链,以及残留,参与es联系人,帮助形成了多畴的活性部位的“盖子”。我们发现残留的骨干灵活性的铰链区(例如,突变的脯氨酸甘氨酸/丙氨酸)影响反应的效率,减少k猫通过大约10倍和增加k m×约2倍。此外,热力学分析表明,这些变化主要是由于熵的影响,符合多肽链的灵活性的增加导致减少的概率形成催化地生产活性部位。这些结果为铰链残留对比与酶的活性位点的突变体,这对酶动力学产生深远的影响(10(2)-10(3)倍降低k猫/ k m)也表现出实质性的差异在他们的热力学参数相对于野生型(WT)的酶。这些研究支持这一概念,多肽蛋白质铰链的灵活性可能进化优化和调优的反应率。