膦酸酯类似物的交互四面体反应中间5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate合成酶在原子的细节。
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抓斗妈,希利ML,贝克,他还DG,巴特利特PA, Lushington GH,美泉宫E
膦酸酯类似物的交互四面体反应中间5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate合成酶在原子的细节。
生物化学,2005年3月8日,44 (9):3241 - 8。
- PubMed ID
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15736934 (在PubMed]
- 文摘
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酶5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate合成酶(EPSPS)催化的倒数第二步shikimate通路,广谱除草剂草甘膦的目标。自shikimate通路的功能是至关重要的不仅对植物也为微生物,EPSPS被认为是一个潜在的目标发展的新型抗生素。我们有活动分析和确定大肠杆菌EPSPS抑制的晶体结构(R) - (S)配置膦酸酯类似物的四面体中间的反应。两个非对映体竞争抑制剂对EPSPS的底物反应,shikimate-3-phosphate (S3P)和磷酸烯醇丙酮酸(PEP)。值得注意的是,(S)膦酸酯(K (iS3P) = 750海里),其配置对应的真正的四面体中间,是一个更弱的抑制剂比(R)膦酸酯类似物(K (iS3P) = 16海里)。EPSPS晶体结构的配体和(S) - (R)为原料,在1.5和1.9分辨率,分别显示的绑定(R)膦酸酯诱发构象变化的严格守恒的残留Arg124和Glu341活性部位。这似乎会导致大量结构性改变伴球状域的酶。相比之下,绑定的(S)膦酸酯呈现酶结构不变。因此,EPSPS可能促进结构的紧密绑定不同的配体通过构象的灵活性。分子对接的计算并没有解释为什么(R)膦酸酯是更好的抑制剂。 Therefore, we propose that the structural events during the open-closed transition of EPSPS are altered as a result of inhibitor action.