副球菌的活性部位denitrificans芳香族氨基酸转氨酶相反属性:灵活性和刚度。
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冈本,Ishii年代,Hirotsu K, Kagamiyama H
副球菌的活性部位denitrificans芳香族氨基酸转氨酶相反属性:灵活性和刚度。
生物化学。1999年1月26日,38 (4):1176 - 84。
- PubMed ID
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9930977 (在PubMed]
- 文摘
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副球菌denitrificans芳香族氨基酸转氨酶(EC 2。6.1.57;pdAroAT)结合一系列脂肪族monocarboxylates依附于庞大的疏水基团。分析这种酶的活性位点的性质,我们确定的三级结构pdAroAT包裹着九个不同抑制剂。这些活性部位结构的对比分析结果显示,pdAroAT由两部分组成的活性部位相反属性:刚性和灵活性。区域与羧化物和亚甲基链抑制剂给了基本相同的结构在这些配合物中,表现出严格的属性,这将涉及修复高效催化的底物在适当的方向。的地区与终端交互抑制剂给多功能结构的疏水基团根据终端组的结构,表明这个地区结构灵活。这主要是通过Asp15的侧链的构象多才多艺,Lys16, Asn142 Arg292, Ser296。这些残留在活性部位形成氢键网络,这是适应终端结构的疏水基团的抑制剂,与小变形或局部破坏的形状和大小根据抑制剂。这些观察结果说明活性部位的灵活性和刚度可以用于衬底绑定和认可。