“cap-binding槽”的信使rna cap-binding蛋白质:芳香族侧链的选择的定量影响双层集装箱三明治帽。
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胡锦涛G, Oguro A, C,革顺PD, Quiocho足总
“cap-binding槽”的信使rna cap-binding蛋白质:芳香族侧链的选择的定量影响双层集装箱三明治帽。
生物化学。2002年6月18日,41 (24):7677 - 87。
- PubMed ID
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12056899 (在PubMed]
- 文摘
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的N7-methylguanine部分mRNA帽结构与cap-binding蛋白质通过一个不同寻常的双层集装箱安排带正电的帽子是夹在两个parallel-oriented芳香族蛋白质侧链。三维costructures帽和两个信使rna cap-binding蛋白质,即平移起始因子eIF4E和VP39(牛痘病毒编码mRNA cap-specific 2》-O-methyltransferase),迄今为止已报告。尽管有惊人的相似之处的两种蛋白质的双栈帽,堆栈中最引人注目的是不同种类的堆叠蛋白质侧链捐赠。而eIF4E雇佣了两个色氨酸,VP39使用酪氨酸和苯丙氨酸。在这里,我们在VP39色氨酸生成替换。色氨酸替换了,结晶学,而不是破坏善意的维护并行堆栈。然而,single-tryptophan double-tryptophan替换和增加亲和力10到50帽核苷的因素,分别。VP39互动更强烈地与一个真正的衬底(包含部分RNA下游的帽除了帽本身)而不是孤立的帽核苷,由几个数量级。VP39突变体与色氨酸替换在180底物催化率表现出明显的缺陷位置在第一次周转周期,表明催化中心的细腻敏感的可能性所带来的微妙的变化在衬底位置改变cap-binding槽。的x射线结构VP39 N7-methylguanosine真正nucleobase模拟,即N7, 9-dimethylguanine,表明N7-methylguanosine转动取向在堆栈帽nucleobase本身的属性。