配体结合域的高分辨率结构的野生型细菌天冬氨酸受体。
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叶,Biemann惠普,Prive GG,潘伟迪J, Koshland DE Jr金SH
配体结合域的高分辨率结构的野生型细菌天冬氨酸受体。
J杂志。1996年9月20日,262 (2):186 - 201。
- PubMed ID
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8831788 (在PubMed]
- 文摘
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野生型的高分辨率结构周质的域的细菌已经确定没有,天冬氨酸受体的天冬氨酸1.85和2.2一项决议,分别。我们早些时候报道,精细结构的复杂形式的交联半胱氨酸突变体受体,在第一个网站绑定的天冬氨酸是通过四个桥接水分子介导的电子密度,而第二个网站显示一个主人最适合硫酸集团目前在高浓度的溶液结晶。在野生型周质的域结构两个天冬氨酸残基绑定/二聚体,但由于不同的入住率。存在一个“强大”aspartate-binding网站绑定的再次由四个水分子而第二个站点包含天冬氨酸的b因子上涨了约10%,标志着较弱的绑定。之间的交互第二,“弱”与三天冬氨酸盐配体结合精氨酸侧链从第一个站点略有不同。的主要区别是,有三个水分子介导的绑定的天冬氨酸在第二个网站,而在第一个站点有四桥接水分子。这一事实aspartate-complexed野生型的晶体生长天冬氨酸大量过剩而交联晶体生长有平等mol / l天冬氨酸可以解释在化学计量学观察到的差异。保护的四个网站强大的天冬氨酸盐桥接水分子的交联与野生型周质的主题域可能反映了一个重要的绑定。周质的领域人群的形式是一个对称的二聚体,每个子单元是等价的,这两个天冬氨酸结合位点是相同的。天冬氨酸绑定后,子单元不再是对称的。 The main difference between the aspartate-bound and unbound forms is in a small, rigid-body rotation between the subunits within a dimer. The rotation is similar in both direction and magnitude in the crosslinked and wild-type periplasmic domains. The presence of the second aspartate in the wild-type structure does not make any additional rotation compared to the single-site binding. The conservation of the small angular change in vitro suggests that the inter-subunit rotation may have relevance to the understanding of the mechanism of transmembrane signal transduction in vivo.