催化机理的大肠杆菌甘氨酰胺核苷酸transformylase定点诱变和pH-dependent研究探索。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
垫片JH, Benkovic SJ
催化机理的大肠杆菌甘氨酰胺核苷酸transformylase定点诱变和pH-dependent研究探索。
生物化学。1999年8月3日,38(31):10024 - 31所示。
- PubMed ID
-
10433709 (在PubMed]
- 文摘
-
定点诱变紧随其后的研究突变体的动力学参数对pH值的依赖关系被用来探测的作用活性部位残留和甘氨酰胺核苷酸循环在催化transformylase (EC 2.1.2.2)。分析突变体的严格守恒的活性位点残基,His108 Asp144,表明His108行为与Asp144盐桥一般酸催化剂pK(一)值为9.7。Asp144也起着关键作用的催化活性部位几何的准备。6 - 10的pH值范围的病原反应一步似乎涉及四面体中间体催化步骤,支持pL的观察(L H或D)独立溶剂同位素氘2的效果。氨基的电离的甘氨酰胺核苷酸作为自由和束缚型占主导地位的动力学行为在低博士分析突变,H121Q,内循环生成氨基酸111 - 131提出的关闭循环参与底物的结合。动力学行为相似之处pH值的影响揭示了一系列的x光酶蛋白的晶体结构和inhibitor-bound酶[苏,Y。山下式,M . M。Greasley美国大肠,马伦,c。垫片,j . H。詹宁斯,p。Benkovic, s . J。威尔逊,中情局(1998)j·摩尔。杂志。281年,485 - 499年),允许一个更精确的制定可能的催化机理。