pH-dependent稳定活性部位的循环观察从低pH值和高晶体结构的突变体单体的甘氨酰胺核苷酸transformylase在1.8到1.9。
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苏Y,山下先生MM, Greasley SE,马伦CA,垫片JH,詹宁斯PA, Benkovic SJ,威尔逊IA
pH-dependent稳定活性部位的循环观察从低pH值和高晶体结构的突变体单体的甘氨酰胺核苷酸transformylase在1.8到1.9。
J杂志。1998年8月21日,281 (3):485 - 99。
- PubMed ID
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9698564 (在PubMed]
- 文摘
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大肠杆菌的二聚体界面的突变甘氨酰胺核苷酸transformylase观察pH-dependent协会(GarTfase)破坏的野生型酶,但酶活性没有显著影响。这里,我们评估是否pH影响酶的构象是充分的本身来解释的pH-dependence GarTfase反应。pH-dependent构象变化之间观察到的两个高分辨率的晶体结构Glu70Ala突变GarTfase pH值3.5(1.8)和7.5(1.9)。残留110年至131年在GarTfase经过转换从一个无序循环pH值3.5,酶的活性,在pH值7.5有序loop-helix结构,酶活性。这种灵活的订购loop-helix有直接影响催化活性部位残留,绑定的叶酸活性部位的代数余子式和屏蔽溶剂。一个主链羰基氧原子从Tyr115命令与His108循环形成氢键,从而提供电子和结构稳定的主要活性部位残留。动力学数据表明的pKa His108实际上是提高到9。2。循环运动可以与高程的pKa,但随着进一步稳定,可能来自Asp144,叶酸代数余子式的绑定。Leu118也在循环,成为p-amino苯甲酸结合位点附近的定位,提供额外的疏水相互作用与代数余子式10-formyl tetrahydrofolate。因此,酶活性的pH-dependence似乎来自当地的活性部位由于monomer-dimer协会重组而非差异。