霍乱病原体霍乱弧菌的两条染色体DNA序列。

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引用

海德堡JF,艾森JA,尼尔森WC,克莱顿RA, Gwinn ML,多德森RJ,哈夫特DH,希基EK,彼得森JD,乌马亚姆L,吉尔SR,尼尔森KE,里德TD,泰特林H,理查德森D,埃尔莫拉耶娃MD,瓦马瑟万J,巴斯S,琴H,德拉戈伊I,塞勒斯P,麦克唐L,厄特贝克T,弗莱什曼RD,尼尔曼WC,怀特O,萨尔茨贝格SL,史密斯HO,科尔韦尔RR,麦卡拉诺斯JJ,文特尔JC,弗雷泽CM

霍乱病原体霍乱弧菌的两条染色体DNA序列。

《自然》2000年8月3日;406(6795):477-83。

PubMed ID
10952301 (PubMed视图
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摘要

在这里,我们确定革兰氏阴性,γ -变形杆菌霍乱弧菌El Tor N16961的完整基因组序列为4,033,460个碱基对(bp)。基因组由两条29611146 bp和1072314 bp的环状染色体组成,共编码3885个开放阅读框。绝大多数具有基本细胞功能(如DNA复制、转录、翻译和细胞壁生物合成)和致病性(如毒素、表面抗原和粘连素)的可识别基因都位于大染色体上。相比之下,与大染色体(42%)相比,小染色体包含更大比例(59%)的假设基因,并且还包含更多似乎起源于γ -变形菌门以外的基因。小染色体还携带一个基因捕获系统(整合子岛)和宿主“成瘾”基因,这些基因通常在质粒上发现;因此,小染色体可能最初是一个被原始弧菌捕获的巨质粒。霍乱弧菌基因组序列为理解自由生活的环境生物如何成为重要的人类细菌病原体提供了一个起点。

引用本文的药物库数据

多肽
的名字 UniProt ID
霍乱肠毒素B亚单位 P01556 细节
无特征的蛋白质 Q9KVB4 细节
DevB蛋白质 Q9KL51 细节
II型分泌系统蛋白E P37093 细节
Beta-hexosaminidase Q9KU37 细节
5 ' -methylthioadenosine / S-adenosylhomocysteine核苷酶 Q9KPI8 细节
CAI-1自诱导合成酶 Q9KM65 细节