杂种狗的结构和动态特征识别蛋白质的核苷酸与诱变8-oxoguanine基地。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
中村T, Meshitsuka年代,北川年代,安倍N,山田J, Ishino T, Nakano H, Tsuzuki T, Doi T,小林Y,藤井裕久年代,Sekiguchi M,山形Y
杂种狗的结构和动态特征识别蛋白质的核苷酸与诱变8-oxoguanine基地。
生物化学杂志。2010年1月1;285 (1):444 - 52。doi: 10.1074 / jbc.M109.066373。Epub 2009年10月28日。
- PubMed ID
-
19864691 (在PubMed]
- 文摘
-
大肠杆菌杂种狗水解8-oxo-dGTP 8-oxo-dGMP,事件可以防止8-oxoguanine相反的错误插入腺嘌呤DNA。展览的几个酶识别8-oxoguanine,小狗的高底物特异性8-oxoguanine核苷酸;然而,这种特异性的结构基础是未知的。晶体结构的杂种狗apo和整体形式和二元和三元形式与产品8-oxo-dGMP 8-oxo-dGMP + Mn(2 +),分别测定。杂种狗严格识别的整体构象8-oxo-dGMP通过氢键的数量。这种识别模式显示,8-oxoguanine核苷酸与鸟嘌呤核苷酸歧视不仅N7-H之间的氢键和Odelta (N119)原子的syn糖苷构象也8-oxoguanine核苷酸。然而,这些歧视因素本身无法解释的大约34000倍区别8-oxo-dGMP和dGMP亲和力的小狗。当小狗的二进制复杂与8-oxo-dGMP与ligand-free形式相比,分类和相当大的运动灵活8-oxo-dGMP周围循环的二进制复杂。这些结果表明,杂种狗专门承认8-oxoguanine ligand-induced核苷酸的构象变化。