完整基因组序列的肠出血性大肠杆菌O157: H7和基因组比较实验室应变k - 12。

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黑川纪章Hayashi T,牧野K,吴建,M K, Ishii K, Yokoyama K,韩寒CG,大坪E, Nakayama K, T村田,田中M,托比T, Iida T, Takami H,本田T,笹川C,小笠原群岛N, Yasunaga T, Kuhara年代,日本柴T,服部年宏M,品川H

完整基因组序列的肠出血性大肠杆菌O157: H7和基因组比较实验室应变k - 12。

DNA研究》2001年2月28日,时间为(1):8月11日至22日。

PubMed ID

11258796 (在PubMed

]

文摘

大肠杆菌O157: H7是主要食源性传染病病原体引起腹泻、出血性结肠炎,溶血性尿毒症综合征。在这里,我们报告的完整的染色体序列O157: H7应变酒井法子爆发隔绝,与良性的实验室和基因的结果比较紧张,k - 12 MG1655。染色体是5.5 Mb, 859 Kb比k - 12。我们发现了一个4.1 mb两菌株之间的高度保守的序列,这可能代表了大肠杆菌染色体的基本支柱。剩余的1.4 mb序列由O157: H7-specific序列,其中大多数是外国dna水平转移。噬菌体的主要角色的出现O157: H7是明显的存在24噬菌体原prophage-like元素占据超过半数的O157: H7-specific序列。O157: H7的染色体编码1632蛋白质和20图示不出现在k - 12。其中,至少有131蛋白质认为virulence-related功能。全基因组密码子使用情况分析表明,O157: H7-specific转运rna参与毒株特异性基因的高效表达。一套完整的基因特定于O157: H7这里提出了新的见解的致病性和生理O157: H7,将打开一个方法完全理解背后的分子机制O157: H7感染。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
2-deoxyglucose-6-phosphate磷酸酶	Q7ADF8	细节
亚砜还原酶催化亚基YedY	Q8XB74	细节
50年代核糖体蛋白戏	P61177	细节
50年代核糖体蛋白L4	P60725	细节
可能UbiX-like黄素prenyltransferase	P69772	细节
肽聚糖D, D-transpeptidase FtsI	P0AD69	细节
精氨酸/胍基丁胺转运体	P60063	细节
5 ' -methylthioadenosine / S-adenosylhomocysteine核苷酶	P0AF14	细节
GrlR	Q7DB61	细节