晶体结构的FMN-dependent硝基还原酶的大肠杆菌B: prodrug-activating酶。
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帕金森GN、史盖企业Neidle年代
晶体结构的FMN-dependent硝基还原酶的大肠杆菌B: prodrug-activating酶。
J地中海化学。2000年10月5日,43(20):3624 - 31所示。
- PubMed ID
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11020276 (在PubMed]
- 文摘
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从大肠杆菌B的FMN-dependent黄素蛋白硝基还原酶用于癌症化疗的最惠国待遇激活一系列高活性化合物。这种酶的晶体结构已经确定,使用分子替代方法和精制2.06一项决议。24-kDa重组酶固定在正方空间群P4(1) 2(1) 2,单胞尺寸的a = b = 57.74 a和c = 275.51和两个分子不对称单位。结构最终R因子为20.3% (R(免费)= 26.7%)之间的所有数据的分辨率范围10 - 2.06,,包括4453个蛋白质原子、230个水分子,2黄素单核苷酸(FMN)分子。为功能单元,形成晶体结构的不对称单元。这两种单体的三级结构及其亚基相互作用是几乎相同的。分子替换搜索模型,晶体结构的主要NAD (P) H:必威国际app FMN氧化还原酶的弧菌fisheri (FRase 1),选择的基础上,其高序列的身份正常。关系这两个酶的最后叠加显示一个非常相似的整体折叠结构的变化集中在表面附近的循环和螺旋FMN代数余子式。螺旋G与底物特异性和更好的解决在目前正常结构关系比之前报道FRase 1结构。FMN绑定的口袋也好看,显示两个渠道存在的主要活性部位。 The amino acid side chains and main chain atoms interacting with the FMN are well-ordered. The structure of the substrate binding pocket has been used to examine substrate specificity and enzyme kinetics for prodrugs used in antibody-directed enzyme prodrug therapy (ADEPT) and gene-directed enzyme prodrug therapy (GDEPT).