四吡咯协调uroporphyrinogen脱羧酶的结构基础。
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菲利普斯JD,惠特比FG,库什纳JP,希尔CP
四吡咯协调uroporphyrinogen脱羧酶的结构基础。
EMBO j . 2003年12月1;22(23):6225 - 33所示。
- PubMed ID
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14633982 (在PubMed]
- 文摘
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Uroporphyrinogen脱羧酶(URO-D),一个重要的酶,这种酶功能血红素生物合成途径中催化脱酸乙酸四组Uroporphyrinogen coproporphyrinogen形式。这里我们报告URO-D复杂的晶体结构我和III异构体coproporphyrinogen产品。结晶需要使用一种新型酶方法生成高度oxygen-sensitive卟啉原基片原位。四吡咯产品采用圆顶构象,谎言的衣领守恒的疏水残基并允许之间的氢键相互作用形成的羧酸盐氧原子不变Asp86残渣和吡咯NH基团。结构和生化分析URO-D蛋白质突变Asp86支持这样的结论:这残留使得绑定和重要贡献可能促进催化反应中间通过稳定一个正电荷。中央协调几何Asp86允许初始基质和各个部分脱羧中间体用等效激活交互,从而解释了醋酸衬底的所有四组可以在同一催化脱羧中心。