精细结构的孔蛋白Rhodopseudomonas blastica。与孔蛋白从Rhodobacter capsulatus。
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通用电气Kreusch,舒尔茨
精细结构的孔蛋白Rhodopseudomonas blastica。与孔蛋白从Rhodobacter capsulatus。
J杂志。1994年11月11日,243 (5):891 - 905。
- PubMed ID
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7525973 (在PubMed]
- 文摘
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膜孔蛋白通道的结构从光养菌Rhodopseudomonas blastica一直在改进1.96决议产生17.6%的r因子。最终的模型由289个氨基酸残基,247个水分子和三个洗涤剂n-octyltetraoxyethylene分子模拟。其中一个洗涤剂分子结合在一起的两个symmetry-related分子紧紧地放在口袋里在分子三倍轴。这个口袋可以绑定三烷基链脂多糖从而稳定三聚物和可能发挥作用在膜插入。这个孔蛋白的整体形状像OmpF大肠杆菌超过唯一已知sequence-related孔蛋白从Rhodobacter capsulatus。膜接触表面是所有已知名叫孔结构相似;它显示了特殊频率的氨基酸残基侧链旋转异构体。46-residue循环β5 beta版的6孔蛋白是紧紧地系在beta-barrel,排除一个体内循环运动,关闭毛孔。三聚物界面区域与一个广泛的水溶性蛋白质的结构表面非极性核心和大量的氢键。在外部循环桶长和僵化的结束而周质的筒一端短和移动。 The crystal packing is discussed.