一般酶酶基因组学:应用程序屏幕发现新酶。
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库兹涅佐娃E, Proudfoot M,桑德斯SA Reinking J, sachenko,阿罗史密斯CH,爱德华兹,雅库宁房颤
一般酶酶基因组学:应用程序屏幕发现新酶。
《启2005年4月,29 (2):263 - 79。
- PubMed ID
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15808744 (在PubMed]
- 文摘
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在所有测序的基因组,一大部分的预测未知基因编码蛋白质的生化功能和高达15%的基因mis-annotated“已知”功能。数家全球方法通常用来预测功能,包括复杂的序列分析、基因表达、蛋白质相互作用和蛋白质结构。在基因组学和酶学的第一耦合,Phizicky和他的同事们进行了一个屏幕为特定酶使用大量部分纯化的蛋白质和特定的酶化验。这里我们提出这种方法的进一步发展的概述,涉及使用通用酶化验屏幕分别纯化酶活性的蛋白质。化验有放松的底物特异性和旨在识别的子类或sub-subclasses酶(磷酸酶,磷酸二酯酶、核酸酶、蛋白酶、酯酶、脱氢酶、氧化酶)未知蛋白所属。进一步的生化特性的蛋白质可以由应用程序来完成二次屏幕与自然基质(底物分析)。我们证明这种方法的可行性和优点水解酶和氧化还原酶两个非常广泛而重要的类的酶。一般酶的应用程序屏幕和衬底分析可以大大加快的生化鉴定功能未知的蛋白质功能预测的实验验证所产生的其他功能基因组学方法。