YbiV来自大肠杆菌K12的磷酸酶。
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罗伯茨,李SY, McCullagh E,银匠再保险,电话
YbiV来自大肠杆菌K12的磷酸酶。
蛋白质。2005年3月1;58 (4):790 - 801。
- PubMed ID
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15657928 (在PubMed]
- 文摘
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大肠杆菌的蛋白质YbiV K12 MG1655是一个假设的蛋白质序列同源性的haloacid dehalogenase(已经)总科的蛋白质。尽管无数的家庭成员已确定,一些已知的函数。使用晶体结构、序列分析、特征和生化检测,我们YbiV作为磷酸酶。YbiV揭示了两个域蛋白的晶体结构,特点有水解酶的折叠,插入另一个α/β折叠。为了理解的机制,我们也解决了和报告的结构在复杂与beryllofluoride YbiV (BeF3)和三氟化铝(AlF3),已证明能模拟水解的磷酸化中间值和过渡态,分别在类比其他磷酸酶。结构的分析,揭示了substrate-binding腔,在本质上是亲水的。结构和序列同源性表明YbiV可能是糖磷酸酶,支持的生化检测,测量自由磷酸盐的释放程度的基质。我们也调查了基因组和功能数据可用以确定生理基质。