RmlC, C3和C5糖差向异构酶,似乎操作通过一个中间有一个不寻常的转折船式构象。

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董C,主要会Srikannathasan V, Errey JC, Giraud MF,林JS, Graninger M, Messner P。麦克内尔先生,风湿性关节炎,Whitfield C,奈史密斯JH

RmlC, C3和C5糖差向异构酶,似乎操作通过一个中间有一个不寻常的转折船式构象。

J杂志。2007年1月5日,365 (1):146 - 59。Epub 2006年9月29日。

PubMed ID
17046787 (在PubMed
]
文摘

碳水化合物的显著特征是他们的宪法,构象和构型的多样性。生物学已经利用这种多样性和操纵碳水化合物残留在各种各样的方面,其中一个是差向异构化作用。RmlC催化的差向异构化作用dTDP-6-deoxy-D-xylo-4-hexulose C3和C5的位置,形成dTDP-6-deoxy-L-lyxo-4-hexulose。RmlC是第三个鼠李糖途径的酶,和代表一个有效的抗菌药物的目标。虽然一些酶已报告的结构,机制和中间体的性质仍不清楚。尽管规模相对较小(kDa 22日),RmlC四个立体定向催化质子转移和衬底经历主要构象变化过程中变换。在这里,我们报告的结构RmlC从几个生物在复杂产品和产品的模仿。我们已经探索基因定点突变体分析和氘交换。的组合结构和生化数据允许我们指定关键残留在营业额和识别碳水化合物的构象。清楚的知识RmlC反应中间体的化学结构可能为理性药物设计提供新的机遇。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽
的名字 UniProt ID
5-epimerase dTDP-4-dehydrorhamnose 3日 P26394 细节
5-epimerase dTDP-4-dehydrorhamnose 3日 Q9HU21 细节
5-epimerase dTDP-4-dehydrorhamnose 3日 P9WH11 细节