三维结构的自由形式和两个底物复合物extradiol开环式加双氧酶,BphC酶从假单胞菌KKS102 sp.压力。
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三维结构的自由形式和两个底物复合物extradiol开环式加双氧酶,BphC酶从假单胞菌KKS102 sp.压力。
J杂志。1996年2月9日,255 (5):735 - 52。
- PubMed ID
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8636975 (在PubMed]
- 文摘
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一种酶的晶体结构有多氯联苯降解活动,从假单胞菌BphC酶KKS102 sp.压力,解决了作为一个免费的形式在1.8一项决议。这是第一个三维结构中extradiol-type加双氧酶。基于34387反射(10.0到1.8,完整性87.8%),20.4%的当前r因子(免费r因子为24.3%)获得了一个模型服从标准几何在0.011债券长度和键角1.91度。BphC酶是homo-octamer和每个单元由两个领域:域1 (n端部分)和域2 (c端部分)。小说的每个域包含两个重复折叠的主题(“βαβββ”主题)每个ca 55个氨基酸残基组成。一个铁离子在活性部位协调三个氨基酸残基的侧链(His145, His209和Glu260)和两个溶剂分子。协调几何是一个正方形的金字塔。除了自由形式的BphC酶,我们已经解决了两个BphC酶的三维结构复杂基质,2,3-dihydroxybiphenyl (2, 3-DHBP)或3-methylcatechol (3-MCT)。这些底物被发现完整的活性位点可能是因为铁离子氧化成三价铁的形式(根据EPR谱)在目前的晶体。在两个底物复合物,两个羟基的衬底,连同三个酶侧链配体,被发现在铁离子形成一个penta-coordinated系统大致安排在一个三角双锥体配置。 The active site structures appear to be essentially consistent with the reaction mechanism proposed so far.