晶体结构的反应中间体及其同系物extradiol-cleaving catecholic加双氧酶。
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佐藤N, Uragami Y, Nishizaki T,高桥Y, Sazaki G,杉本K,野中郁次郎T,马赛E,上帝福田M T
晶体结构的反应中间体及其同系物extradiol-cleaving catecholic加双氧酶。
J杂志。2002年8月23日,321 (4):621 - 36。
- PubMed ID
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12206778 (在PubMed]
- 文摘
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BphC来自假单胞菌sp.应变KKS102是extradiol-cleaving catecholic加双氧酶。这种酶含有一个非血红素铁原子和中发挥着重要作用降解联苯/多氯联苯(pcb)的微生物。阐明BphC反应中间体的详细结构,晶体结构的substrate-free形式,BphC-substrate复杂,BphC-substrate-NO(一氧化氮)复杂的测定。这些晶体结构显示(1)O(2)分子的结合位点在协调领域和(2)构象变化的His194催化反应。这些研究结果的基础上,我们提出一个催化机制extradiol-cleaving catecholic加双氧酶His194似乎扮演三个不同的角色。在催化反应的早期阶段,His194似乎作为催化基础,可能deprotonates羟基的底物。下一个阶段,使质子化His194似乎稳定一个负电荷在O2分子位于疏水O2-binding腔。最后,质子化了的His194似乎作为质子给予体,提出了其存在。