R115E突变体的三维结构T4-bacteriophage 2》-deoxycytidylate脱氨酶。
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Almog R, Maley F, Maley GF, Maccoll R, Van Roey P
R115E突变体的三维结构T4-bacteriophage 2》-deoxycytidylate脱氨酶。
生物化学。2004年11月2日,43(43):13715 - 23所示。
- PubMed ID
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15504034 (在PubMed]
- 文摘
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2》-Deoxycytidylate脱氨酶(以便)转换脱氧胞苷5 '一磷酸(dCMP)脱氧尿苷5 '一磷酸,是一个主要供应商thymidylate合成酶的底物,DNA合成的重要酶和癌症化疗的一个主要目标。野生型dCD计划的变构调节代谢途径的终端产品,脱氧胞苷5 '三磷酸脱氧胸苷5 '三磷酸,分别作为催化剂和抑制剂。民国第一晶体结构,T4-bacteriophage R115E突变的形式的酶和活性位点抑制剂pyrimidin-2-one deoxyribotide,已经确定在2.2一项决议。这种突变的活跃,即使没有监管机构的变构。dCD计划相关的分子拓扑结构的胞嘧啶核苷脱氨酶(CDA),但与修改形成dCMP的磷酸基的结合位点。酶有锌ion-based CDA的机制类似。第二个锌离子存在于噬菌体dCD计划的,但没有在哺乳动物和CDA, dCD计划是很重要的对于酶的结构完整性和绑定的磷酸基底物或抑制剂。虽然R115E突变的一个二聚体在溶液中,它作为六聚物结晶,模仿野生型酶的自然状态。残留112年和115年,被认为是重要的具有约束力的变构监管者,在口袋里发现是在六聚体intersubunit接口但远离substrate-binding站点。substrate-binding站点从单个蛋白质分子组成的残留物,隐藏在一个深沟。 This groove is located at the outer surface of the hexamer but ends at the subunit interface that also includes residue 115. It is proposed that the absence of subunit interactions at this interface in the dimeric R115E mutant renders the substrate-binding site accessible. In contrast, for the wild-type enzyme, binding of dCTP induces an allosteric effect that affects the subunit interactions and results in an increase in the accessibility of the binding site.